菠菜病害图片:什么是密码子偏性系数及其范围

局部密码子偏性与高(低)表达关系
为了探讨5`与3`端局部密码子偏性
与高(低)表达关系,利用Goldkey软件
计算下列值:X1,X2,...，X30；Y1，
Y2，...，Y30。并且运用判别分析方法
考察Xi与Yj的所有可能900种组合与高(低)
表达的关系,结果发现:有8种组合,P值较小,
详见下表。

表：5'和3'端局部密码子偏性联合作用与高(低)表达关系
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5‘偏性 3’偏性 F值 概率 判别符合率
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X1 Y3 5.4572 0.0362 73.3%
X3 Y3 3.0462 0.0851 73.3%
X4 Y3 3.0686 0.0839 73.3%
X9 Y3 3.2001 0.0769 73.3%
X10 Y2 3.1687 0.0785 80.0%
X10 Y3 3.4554 0.0653 66.7%
X11 Y3 3.0782 0.0834 66.7%
X12 Y3 2.9887 0.0885 66.7%
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由上表可以看出: P值均在0.05左右摆动,以Y3的
P值最小(因X1=1), 并得到下列判别方程:
LEC3=-0.44192+30.73696*Y3 (9)
HEC3=-2.35737+70.99093*Y3 (10)
P≤0.0362,由判别准则可得到外源基因高效表达
条件是: Y 3≥ 0.04758,即要求外源基因3`端的
3个密码子(包括TAA)必须是大肠杆菌的优势密码。